Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Epb41l4aP52963 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Epb41l4aP52963 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Epb41l4aP52963 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Epb41l4aP52963 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Epb41l4aP52963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Epb41l4aP52963 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Epb41l4aP52963 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Epb41l4aP52963 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Epb41l4aP52963 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms