Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Pa2g4P50580 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pa2g4P50580 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pa2g4P50580 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Pa2g4P50580 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pa2g4P50580 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pa2g4P50580 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pa2g4P50580 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pa2g4P50580 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pa2g4P50580 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms