Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LtbrP50284 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LtbrP50284 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtbrP50284 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LtbrP50284 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LtbrP50284 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LtbrP50284 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LtbrP50284 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LtbrP50284 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LtbrP50284 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LtbrP50284 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LtbrP50284 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LtbrP50284 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms