Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ercc3P49135 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ercc3P49135 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc3P49135 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc3P49135 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ercc3P49135 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ercc3P49135 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc3P49135 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc3P49135 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms