Protein–RNA interactions for Protein: P48986

Neurod6, Neurogenic differentiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod6P48986 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28,98■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,97■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,96■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,96■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Neurod6P48986 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28,9■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28,89■■■□□ 2,22
Neurod6P48986 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28,85■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28,83■■■□□ 2,21
Neurod6P48986 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28,82■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,77■■■□□ 2,2
Neurod6P48986 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,72■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Neurod6P48986 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28,7■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Neurod6P48986 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,58■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Neurod6P48986 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,56■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,16
Neurod6P48986 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Neurod6P48986 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Neurod6P48986 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,5■■■□□ 2,15
Neurod6P48986 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Neurod6P48986 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Neurod6P48986 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28,49■■■□□ 2,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,8 ms