Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Edn3P48299 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edn3P48299 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Edn3P48299 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Edn3P48299 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Edn3P48299 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Edn3P48299 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Edn3P48299 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edn3P48299 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Edn3P48299 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edn3P48299 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Edn3P48299 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edn3P48299 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Edn3P48299 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edn3P48299 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edn3P48299 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edn3P48299 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn3P48299 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Edn3P48299 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Edn3P48299 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms