Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli1P47806 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli1P47806 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli1P47806 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli1P47806 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gli1P47806 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gli1P47806 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli1P47806 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gli1P47806 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli1P47806 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli1P47806 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gli1P47806 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gli1P47806 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli1P47806 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gli1P47806 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gli1P47806 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli1P47806 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gli1P47806 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gli1P47806 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms