Protein–RNA interactions for Protein: P46978

Stt3a, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3A, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3aP46978 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Stt3aP46978 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Stt3aP46978 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Stt3aP46978 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Stt3aP46978 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Stt3aP46978 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Stt3aP46978 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms