Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11bP46638 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab11bP46638 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab11bP46638 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rab11bP46638 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab11bP46638 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab11bP46638 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms