Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Syt1P46096 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Syt1P46096 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syt1P46096 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt1P46096 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Syt1P46096 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Syt1P46096 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syt1P46096 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Syt1P46096 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syt1P46096 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syt1P46096 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Syt1P46096 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Syt1P46096 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syt1P46096 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syt1P46096 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Syt1P46096 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Syt1P46096 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syt1P46096 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Syt1P46096 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syt1P46096 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Syt1P46096 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Syt1P46096 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Syt1P46096 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Syt1P46096 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt1P46096 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt1P46096 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Syt1P46096 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Syt1P46096 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Syt1P46096 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Syt1P46096 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms