Protein–RNA interactions for Protein: P43267

Sox15, Protein SOX-15, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox15P43267 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox15P43267 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sox15P43267 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox15P43267 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sox15P43267 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox15P43267 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sox15P43267 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sox15P43267 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sox15P43267 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox15P43267 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sox15P43267 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sox15P43267 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox15P43267 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Sox15P43267 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox15P43267 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox15P43267 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sox15P43267 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms