Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AboP38649 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AboP38649 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AboP38649 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AboP38649 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AboP38649 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AboP38649 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AboP38649 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AboP38649 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AboP38649 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AboP38649 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
AboP38649 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AboP38649 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AboP38649 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AboP38649 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AboP38649 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AboP38649 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AboP38649 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AboP38649 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AboP38649 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AboP38649 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AboP38649 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AboP38649 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AboP38649 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AboP38649 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AboP38649 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AboP38649 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AboP38649 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AboP38649 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AboP38649 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AboP38649 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AboP38649 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AboP38649 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AboP38649 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AboP38649 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AboP38649 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AboP38649 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AboP38649 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AboP38649 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AboP38649 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AboP38649 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AboP38649 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AboP38649 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AboP38649 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AboP38649 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AboP38649 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AboP38649 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AboP38649 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AboP38649 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AboP38649 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AboP38649 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
AboP38649 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
AboP38649 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
AboP38649 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AboP38649 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AboP38649 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
AboP38649 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AboP38649 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AboP38649 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AboP38649 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AboP38649 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AboP38649 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AboP38649 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AboP38649 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AboP38649 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AboP38649 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AboP38649 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms