Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Acvr1P37172 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Acvr1P37172 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Acvr1P37172 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acvr1P37172 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acvr1P37172 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Acvr1P37172 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms