Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sar1aP36536 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sar1aP36536 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sar1aP36536 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sar1aP36536 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sar1aP36536 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms