Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab6aP35279 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Rab6aP35279 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab6aP35279 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab6aP35279 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab6aP35279 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms