Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Apoc1P34928 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Apoc1P34928 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Apoc1P34928 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Apoc1P34928 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Apoc1P34928 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms