Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SsbP32067 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SsbP32067 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SsbP32067 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SsbP32067 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SsbP32067 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SsbP32067 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SsbP32067 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SsbP32067 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SsbP32067 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SsbP32067 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SsbP32067 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SsbP32067 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SsbP32067 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SsbP32067 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SsbP32067 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SsbP32067 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SsbP32067 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SsbP32067 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SsbP32067 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SsbP32067 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SsbP32067 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SsbP32067 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SsbP32067 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SsbP32067 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SsbP32067 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SsbP32067 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SsbP32067 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SsbP32067 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SsbP32067 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SsbP32067 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SsbP32067 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SsbP32067 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SsbP32067 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SsbP32067 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SsbP32067 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SsbP32067 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SsbP32067 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SsbP32067 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SsbP32067 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SsbP32067 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SsbP32067 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SsbP32067 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SsbP32067 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SsbP32067 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SsbP32067 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SsbP32067 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SsbP32067 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SsbP32067 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SsbP32067 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SsbP32067 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SsbP32067 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SsbP32067 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SsbP32067 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SsbP32067 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SsbP32067 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SsbP32067 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SsbP32067 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SsbP32067 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SsbP32067 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SsbP32067 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SsbP32067 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SsbP32067 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SsbP32067 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SsbP32067 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SsbP32067 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SsbP32067 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SsbP32067 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SsbP32067 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SsbP32067 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SsbP32067 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SsbP32067 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SsbP32067 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SsbP32067 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SsbP32067 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SsbP32067 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SsbP32067 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SsbP32067 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SsbP32067 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SsbP32067 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SsbP32067 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SsbP32067 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SsbP32067 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SsbP32067 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SsbP32067 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms