Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc5P32043 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxc5P32043 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hoxc5P32043 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hoxc5P32043 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hoxc5P32043 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hoxc5P32043 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms