Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3aP28741 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Kif3aP28741 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kif3aP28741 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kif3aP28741 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Kif3aP28741 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Kif3aP28741 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms