Protein–RNA interactions for Protein: P28667

Marcksl1, MARCKS-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Marcksl1P28667 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Marcksl1P28667 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Marcksl1P28667 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Marcksl1P28667 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Marcksl1P28667 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Marcksl1P28667 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Marcksl1P28667 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms