Protein–RNA interactions for Protein: P28293

Ctsg, Cathepsin G, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsgP28293 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CtsgP28293 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CtsgP28293 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CtsgP28293 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CtsgP28293 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CtsgP28293 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CtsgP28293 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CtsgP28293 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms