Protein–RNA interactions for Protein: P27784

Ccl6, C-C motif chemokine 6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl6P27784 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18,21■□□□□ 0,51
Ccl6P27784 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18,18■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18,17■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,5
Ccl6P27784 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18,13■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18,09■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18,09■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18,08■□□□□ 0,49
Ccl6P27784 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18,08■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18,07■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,48
Ccl6P27784 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17,99■□□□□ 0,47
Ccl6P27784 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,99■□□□□ 0,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms