Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tgfb2P27090 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tgfb2P27090 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29,53■■■□□ 2,32
Tgfb2P27090 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,47■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Tgfb2P27090 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Tgfb2P27090 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29,38■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29,36■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29,35■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29,34■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Tgfb2P27090 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29,31■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29,29■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29,27■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,28
Tgfb2P27090 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29,26■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Tgfb2P27090 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29,18■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29,17■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Tgfb2P27090 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29,12■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Tgfb2P27090 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,5 ms