Protein–RNA interactions for Protein: P22935

Crabp2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp2P22935 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Crabp2P22935 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Crabp2P22935 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crabp2P22935 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Crabp2P22935 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Crabp2P22935 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Crabp2P22935 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms