Protein–RNA interactions for Protein: P21995

Emb, Embigin, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EmbP21995 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EmbP21995 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EmbP21995 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EmbP21995 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EmbP21995 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EmbP21995 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EmbP21995 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EmbP21995 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EmbP21995 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EmbP21995 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EmbP21995 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EmbP21995 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EmbP21995 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EmbP21995 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EmbP21995 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EmbP21995 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EmbP21995 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EmbP21995 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EmbP21995 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EmbP21995 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EmbP21995 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EmbP21995 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EmbP21995 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EmbP21995 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EmbP21995 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EmbP21995 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EmbP21995 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EmbP21995 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EmbP21995 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EmbP21995 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EmbP21995 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EmbP21995 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EmbP21995 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EmbP21995 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EmbP21995 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EmbP21995 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EmbP21995 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EmbP21995 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EmbP21995 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EmbP21995 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EmbP21995 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EmbP21995 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EmbP21995 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EmbP21995 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EmbP21995 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EmbP21995 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EmbP21995 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EmbP21995 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EmbP21995 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EmbP21995 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EmbP21995 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EmbP21995 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EmbP21995 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EmbP21995 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EmbP21995 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EmbP21995 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EmbP21995 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EmbP21995 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EmbP21995 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EmbP21995 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EmbP21995 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EmbP21995 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EmbP21995 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EmbP21995 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EmbP21995 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EmbP21995 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EmbP21995 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EmbP21995 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EmbP21995 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EmbP21995 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EmbP21995 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EmbP21995 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EmbP21995 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EmbP21995 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EmbP21995 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EmbP21995 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EmbP21995 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EmbP21995 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EmbP21995 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EmbP21995 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EmbP21995 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EmbP21995 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EmbP21995 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EmbP21995 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EmbP21995 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EmbP21995 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EmbP21995 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EmbP21995 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms