Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tap1P21958 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tap1P21958 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tap1P21958 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tap1P21958 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tap1P21958 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tap1P21958 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tap1P21958 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tap1P21958 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tap1P21958 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tap1P21958 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tap1P21958 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tap1P21958 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tap1P21958 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tap1P21958 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tap1P21958 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tap1P21958 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tap1P21958 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tap1P21958 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tap1P21958 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tap1P21958 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tap1P21958 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tap1P21958 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tap1P21958 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tap1P21958 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tap1P21958 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tap1P21958 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tap1P21958 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tap1P21958 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tap1P21958 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms