Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fcer1aP20489 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fcer1aP20489 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fcer1aP20489 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fcer1aP20489 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fcer1aP20489 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms