Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F3P20352 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
F3P20352 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F3P20352 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
F3P20352 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
F3P20352 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
F3P20352 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F3P20352 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
F3P20352 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
F3P20352 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
F3P20352 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
F3P20352 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
F3P20352 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
F3P20352 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
F3P20352 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
F3P20352 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F3P20352 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F3P20352 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
F3P20352 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
F3P20352 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F3P20352 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F3P20352 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F3P20352 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
F3P20352 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
F3P20352 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
F3P20352 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
F3P20352 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F3P20352 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
F3P20352 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
F3P20352 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
F3P20352 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
F3P20352 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
F3P20352 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F3P20352 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
F3P20352 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F3P20352 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
F3P20352 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
F3P20352 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
F3P20352 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F3P20352 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F3P20352 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
F3P20352 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
F3P20352 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F3P20352 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
F3P20352 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
F3P20352 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F3P20352 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F3P20352 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
F3P20352 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
F3P20352 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
F3P20352 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
F3P20352 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F3P20352 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
F3P20352 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
F3P20352 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
F3P20352 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
F3P20352 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
F3P20352 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
F3P20352 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
F3P20352 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
F3P20352 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F3P20352 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
F3P20352 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
F3P20352 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F3P20352 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
F3P20352 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F3P20352 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F3P20352 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
F3P20352 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F3P20352 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
F3P20352 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
F3P20352 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
F3P20352 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
F3P20352 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
F3P20352 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
F3P20352 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
F3P20352 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
F3P20352 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
F3P20352 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F3P20352 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F3P20352 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
F3P20352 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
F3P20352 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms