Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou5f1P20263 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou5f1P20263 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pou5f1P20263 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pou5f1P20263 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou5f1P20263 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou5f1P20263 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms