Protein–RNA interactions for Protein: P19001

Krt19, Keratin, type I cytoskeletal 19, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt19P19001 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt19P19001 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt19P19001 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt19P19001 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt19P19001 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt19P19001 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt19P19001 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt19P19001 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt19P19001 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt19P19001 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt19P19001 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt19P19001 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt19P19001 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt19P19001 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt19P19001 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt19P19001 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt19P19001 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Krt19P19001 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt19P19001 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt19P19001 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Krt19P19001 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms