Protein–RNA interactions for Protein: P18524

Ig heavy chain V region RF, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18524 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18524 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18524 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P18524 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18524 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18524 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18524 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P18524 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P18524 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P18524 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18524 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18524 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
P18524 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P18524 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P18524 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
P18524 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P18524 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P18524 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P18524 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
P18524 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
P18524 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P18524 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P18524 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
P18524 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
P18524 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
P18524 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P18524 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P18524 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P18524 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P18524 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P18524 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P18524 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P18524 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
P18524 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18524 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P18524 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18524 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18524 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18524 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P18524 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P18524 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P18524 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
P18524 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P18524 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18524 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18524 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P18524 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18524 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
P18524 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18524 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18524 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P18524 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18524 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18524 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18524 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18524 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P18524 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
P18524 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P18524 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
P18524 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P18524 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
P18524 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18524 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18524 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P18524 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
P18524 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18524 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18524 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
P18524 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18524 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18524 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
P18524 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
P18524 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P18524 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
P18524 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
P18524 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
P18524 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
P18524 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
P18524 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
P18524 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18524 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18524 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
P18524 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18524 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
P18524 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18524 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18524 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
P18524 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P18524 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
P18524 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms