Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcnaP17918 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PcnaP17918 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcnaP17918 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PcnaP17918 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcnaP17918 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PcnaP17918 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PcnaP17918 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcnaP17918 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcnaP17918 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcnaP17918 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcnaP17918 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PcnaP17918 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcnaP17918 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcnaP17918 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcnaP17918 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PcnaP17918 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PcnaP17918 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcnaP17918 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PcnaP17918 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms