Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tgfb3P17125 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tgfb3P17125 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tgfb3P17125 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tgfb3P17125 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tgfb3P17125 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb3P17125 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tgfb3P17125 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb3P17125 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms