Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Kcnc1P15388 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Kcnc1P15388 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kcnc1P15388 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kcnc1P15388 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kcnc1P15388 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms