Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vpreb2P13373 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vpreb2P13373 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vpreb2P13373 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms