Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scg5P12961 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scg5P12961 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scg5P12961 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Scg5P12961 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg5P12961 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scg5P12961 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg5P12961 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scg5P12961 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scg5P12961 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scg5P12961 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scg5P12961 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms