Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cd1d1P11609 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cd1d1P11609 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cd1d1P11609 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cd1d1P11609 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cd1d1P11609 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms