Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pax1P09084 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax1P09084 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax1P09084 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax1P09084 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pax1P09084 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax1P09084 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pax1P09084 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax1P09084 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax1P09084 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax1P09084 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax1P09084 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pax1P09084 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax1P09084 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax1P09084 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax1P09084 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax1P09084 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pax1P09084 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms