Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtrP07309 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtrP07309 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TtrP07309 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtrP07309 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtrP07309 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TtrP07309 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TtrP07309 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtrP07309 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtrP07309 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtrP07309 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtrP07309 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TtrP07309 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TtrP07309 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtrP07309 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtrP07309 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TtrP07309 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TtrP07309 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TtrP07309 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TtrP07309 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TtrP07309 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TtrP07309 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TtrP07309 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtrP07309 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtrP07309 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtrP07309 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtrP07309 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TtrP07309 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtrP07309 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtrP07309 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtrP07309 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TtrP07309 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TtrP07309 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtrP07309 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtrP07309 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtrP07309 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TtrP07309 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtrP07309 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtrP07309 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtrP07309 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TtrP07309 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtrP07309 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtrP07309 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TtrP07309 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TtrP07309 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TtrP07309 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TtrP07309 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtrP07309 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtrP07309 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtrP07309 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtrP07309 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TtrP07309 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtrP07309 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtrP07309 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtrP07309 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TtrP07309 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TtrP07309 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtrP07309 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtrP07309 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TtrP07309 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtrP07309 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtrP07309 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtrP07309 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtrP07309 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TtrP07309 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TtrP07309 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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