Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoa4P06728 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoa4P06728 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apoa4P06728 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoa4P06728 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoa4P06728 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms