Protein–RNA interactions for Protein: P05531

Xlr, X-linked lymphocyte-regulated protein PM1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XlrP05531 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XlrP05531 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XlrP05531 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XlrP05531 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
XlrP05531 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
XlrP05531 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
XlrP05531 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XlrP05531 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
XlrP05531 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
XlrP05531 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XlrP05531 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XlrP05531 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
XlrP05531 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XlrP05531 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XlrP05531 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
XlrP05531 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
XlrP05531 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
XlrP05531 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
XlrP05531 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
XlrP05531 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XlrP05531 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XlrP05531 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XlrP05531 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
XlrP05531 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
XlrP05531 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XlrP05531 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
XlrP05531 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XlrP05531 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
XlrP05531 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XlrP05531 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XlrP05531 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XlrP05531 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XlrP05531 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XlrP05531 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XlrP05531 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XlrP05531 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XlrP05531 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XlrP05531 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XlrP05531 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XlrP05531 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XlrP05531 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XlrP05531 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XlrP05531 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XlrP05531 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XlrP05531 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XlrP05531 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XlrP05531 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XlrP05531 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XlrP05531 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XlrP05531 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XlrP05531 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XlrP05531 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XlrP05531 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XlrP05531 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
XlrP05531 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
XlrP05531 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XlrP05531 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XlrP05531 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XlrP05531 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XlrP05531 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XlrP05531 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XlrP05531 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XlrP05531 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XlrP05531 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XlrP05531 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XlrP05531 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XlrP05531 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XlrP05531 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XlrP05531 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XlrP05531 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XlrP05531 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XlrP05531 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XlrP05531 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XlrP05531 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XlrP05531 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms