Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tk1P04184 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tk1P04184 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tk1P04184 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tk1P04184 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tk1P04184 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tk1P04184 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tk1P04184 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk1P04184 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tk1P04184 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tk1P04184 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk1P04184 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tk1P04184 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk1P04184 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tk1P04184 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tk1P04184 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tk1P04184 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk1P04184 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk1P04184 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tk1P04184 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk1P04184 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk1P04184 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tk1P04184 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tk1P04184 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms