Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01672 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
P01672 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01672 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01672 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01672 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01672 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01672 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01672 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01672 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
P01672 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01672 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01672 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01672 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
P01672 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01672 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01672 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01672 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01672 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01672 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01672 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P01672 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01672 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01672 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01672 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01672 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01672 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01672 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01672 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01672 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01672 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01672 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P01672 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01672 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
P01672 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01672 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01672 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
P01672 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01672 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01672 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
P01672 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01672 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01672 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01672 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01672 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
P01672 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01672 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
P01672 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
P01672 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
P01672 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01672 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01672 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01672 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01672 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
P01672 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01672 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
P01672 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01672 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01672 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
P01672 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01672 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01672 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
P01672 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01672 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01672 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01672 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P01672 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01672 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01672 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01672 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01672 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01672 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01672 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
P01672 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms