Protein–RNA interactions for Protein: O88990

Actn3, Alpha-actinin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn3O88990 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Actn3O88990 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Actn3O88990 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Actn3O88990 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Actn3O88990 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn3O88990 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn3O88990 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Actn3O88990 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Actn3O88990 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Actn3O88990 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Actn3O88990 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Actn3O88990 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn3O88990 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Actn3O88990 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Actn3O88990 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Actn3O88990 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn3O88990 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Actn3O88990 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn3O88990 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn3O88990 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Actn3O88990 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms