Protein–RNA interactions for Protein: O88643

Pak1, Serine/threonine-protein kinase PAK 1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak1O88643 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pak1O88643 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pak1O88643 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pak1O88643 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pak1O88643 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pak1O88643 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pak1O88643 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pak1O88643 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pak1O88643 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pak1O88643 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pak1O88643 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pak1O88643 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pak1O88643 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pak1O88643 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pak1O88643 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pak1O88643 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pak1O88643 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pak1O88643 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pak1O88643 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pak1O88643 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pak1O88643 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pak1O88643 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pak1O88643 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.9 ms