Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ComtO88587 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ComtO88587 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ComtO88587 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ComtO88587 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ComtO88587 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ComtO88587 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ComtO88587 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ComtO88587 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ComtO88587 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ComtO88587 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ComtO88587 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ComtO88587 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ComtO88587 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ComtO88587 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ComtO88587 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ComtO88587 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ComtO88587 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ComtO88587 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ComtO88587 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ComtO88587 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ComtO88587 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ComtO88587 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ComtO88587 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ComtO88587 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ComtO88587 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ComtO88587 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ComtO88587 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ComtO88587 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ComtO88587 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ComtO88587 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ComtO88587 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ComtO88587 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ComtO88587 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ComtO88587 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ComtO88587 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ComtO88587 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ComtO88587 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ComtO88587 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ComtO88587 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ComtO88587 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ComtO88587 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ComtO88587 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ComtO88587 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ComtO88587 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ComtO88587 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ComtO88587 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ComtO88587 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ComtO88587 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ComtO88587 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ComtO88587 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ComtO88587 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ComtO88587 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ComtO88587 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ComtO88587 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ComtO88587 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ComtO88587 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ComtO88587 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ComtO88587 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ComtO88587 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ComtO88587 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ComtO88587 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ComtO88587 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ComtO88587 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ComtO88587 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ComtO88587 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ComtO88587 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ComtO88587 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ComtO88587 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ComtO88587 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ComtO88587 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ComtO88587 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ComtO88587 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ComtO88587 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ComtO88587 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ComtO88587 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ComtO88587 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ComtO88587 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ComtO88587 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ComtO88587 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ComtO88587 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ComtO88587 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ComtO88587 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ComtO88587 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ComtO88587 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ComtO88587 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ComtO88587 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ComtO88587 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ComtO88587 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ComtO88587 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ComtO88587 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ComtO88587 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ComtO88587 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ComtO88587 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ComtO88587 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.3 ms