Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vamp8O70404 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vamp8O70404 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vamp8O70404 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vamp8O70404 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.5 ms