Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NmbrO54799 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmbrO54799 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbrO54799 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbrO54799 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NmbrO54799 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NmbrO54799 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NmbrO54799 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NmbrO54799 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NmbrO54799 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NmbrO54799 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NmbrO54799 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmbrO54799 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NmbrO54799 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NmbrO54799 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NmbrO54799 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmbrO54799 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NmbrO54799 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms