Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nek2O35942 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek2O35942 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek2O35942 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nek2O35942 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek2O35942 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nek2O35942 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nek2O35942 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nek2O35942 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nek2O35942 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek2O35942 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nek2O35942 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nek2O35942 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek2O35942 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek2O35942 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek2O35942 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek2O35942 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek2O35942 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek2O35942 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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