Protein–RNA interactions for Protein: O35657

Neu1, Sialidase-1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu1O35657 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neu1O35657 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Neu1O35657 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Neu1O35657 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Neu1O35657 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neu1O35657 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neu1O35657 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Neu1O35657 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neu1O35657 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Neu1O35657 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neu1O35657 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neu1O35657 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Neu1O35657 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms